DNA-Barcoding Service

Für Standardbestimmungen verwenden wir je nach Ausgangs-material ausschließlich anerkannte und wissenschaftlich verifizierte Barcoding-Regionen (COI, 16S, ITS, rbcL etc.).

 

Auf speziellen Wunsch können auch andere Genregionen oder sogenannte "Mini-Barcodes" analysiert werden.


Was ist DNA-Barcoding?

 

DNA-Barcoding ist die Identifikation eines Organismus durch Sequenzierung eines definierten Genabschnitts (Barcoding-Fragment). In einem ersten Schritt wird die DNA isoliert und das Barcoding-Fragment durch PCR vervielfältigt. Danach erfolgt die Sequenzierung des PCR-Produkts mit der Sanger-Methode. Die DNA-Sequenz wird dann mit einer Referenzdatenbank abgeglichen. Bei sehr hoher Übereinstimmung (> 98 %) kann die unbekannte Proben einer bereits bekannten Art zugeordnet werden.

Wir identifizieren

  • Tiere (Fische, Amphibien, Säugetiere, Insekten, Krebstiere etc.)
  • Pflanzen und Algen
  • Pilze

 

Wir bearbeiten

  • Ganze Organismen
  • Eier, Larven-, Puppen- und Juvenilstadien
  • Teile und Spuren von Organismen (Gewebe, Haut, Fell, Federn, Schuppen, Blut etc.)

 

Unsere Analyse beinhaltet

  • Probenvorbereitung
  • DNA-Extraktion
  • PCR mit Standard oder kundendefinierten Primern
  • Qualitätskontrolle
  • Aufreinigung der Amplicons
  • Sanger Sequenzierung (Hin- und/oder Rückstrang)
  • Editierung und Erstellung der Konsensussequenzen
  • Abgleich der Sequenzen mit Referenzdatenbanken (BOLD, GenBank)
  • Dokumentation der Ergebnisse

Anforderungen an die Proben

 

Die Qualität der Ergebnisse ist abhängig von der DNA-Qualität in der Probe.

Dazu müssen die Proben entweder gefroren, getrocknet oder in einem geeigneten

Fixiermedium (Ethanol, RNA later, DMSO, DESS etc.) aufbewahrt werden.

 

Für die Lagerung von Proben gilt ganz allgemein, dass durch eine trockene, dunkle

und kühle Lagerung (z.B. bei -20 °C im Gefrierschrank) die DNA-Qualität der Proben hoch bleibt.

 

 

Probenversand

 

Für den Versand von frischem Ausgangsmaterial bietet sich eine Fixierung in 96-prozentigem  Ethanol (unvergällt) in einem geeignetem Gefäß an (z.B. Eppendorf oder Falcon Tubes 1,5-50 ml).

Pflanzenteile und genadelte Insekten können auch getrocknet versandt werden.

 

Gerne beraten wir Sie über die geeignete Vorgehensweise bei Ihren Proben.

Noch Fragen?

Kosten

 

Unser Komplettservice ist ab 30,00 EUR (zzgl. MwSt.) pro Probe erhältlich. Die Preise variieren je nach Anzahl der Proben und der Beschaffenheit des Ausgangsmaterials.

 

Wir erstellen gerne ein individuelles Angebot.

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